Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLH3Q9UHC1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms