Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DBF4Q9UBU7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms