Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC180Q9P1Z9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms