Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms