Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms