Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms