Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms