Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB9BQ9NP90 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms