Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4CQ9C0C4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms