Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms