Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms