Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms