Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms