Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms