Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms