Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms