Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms