Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms