Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms