Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM227BQ96M60 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms