Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ1Q96JM4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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