Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG3Q96JB2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms