Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms