Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRG4Q92954 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms