Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GIPC3Q8TF64 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms