Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms