Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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