Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM71DQ8N9W8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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