Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGD6Q6ZV73 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms