Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms