Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LETMD1Q6P1Q0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms