Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms