Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms