Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf140Q5VVS0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms