Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP170Q5SW79 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms