Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms