Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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