Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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