Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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