Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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