Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SS18Q15532 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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SS18Q15532 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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