Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms