Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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