Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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