Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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