Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCOA4Q13772 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms