Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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