Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
XRCC4Q13426 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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