Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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