Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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